Планы всеобщего восстания, проведение которого было главной целью АК, подвергались многокрактным изменениям. Первый план возник еще в период существования советско-немецкого союза, второй когда Советский Союз стал членом антигитлеровской коалиции. Последний был разработан осенью 1943 г., после того, как были порваны Москвой дипломатические отношения с Польшей и когда стало известно, что на территорию Польши первой войдет Красная Армия. Согласно этому плану восстание получило условное название «Буря». Он предусматривал, что в момент приближения фронта все подразделения и структуры АК будут находится в состоянии полной боевой готовности, примут названия довоенных частей Войска Польского (дивизий и полков), усилят диверсионные акции, а прежде всего начнут открытую борьбу с отступающими немецкими подразделениями, пытаясь установить контакт на тактическом уровне с Красной Армией. В освобожденных городах легализуется и возьмет власть в свои руки подпольная администрация (областные и окружные представительства), которая в качестве хозяина территории будет встречать советские войска. Восстание должно было носить черты последовательной акции, а не однократного выступления на всей территории государства.

«Буря» началась 15 января 1944 г. мобилизацией на Волыни (польские восточные границы), где местные отряды - преобразованные в 27-ю Волынскую Дивизию Пехоты АК - предприняли действия против немцев. Однако, когда в ходе боев отряды АК должны были перейти линию фронта их обезоруживало НКВД. Несмотря на эти негативные явления Главная Комендатура АК решила продолжать акцию «Буря». Очередные мобилизованные отряды вступали в акцию, а крупнейшая группировка вместе с Красной Армией принимала участие в битве за Вильнюс (6-7 июля). Через несколько дней после завершения боев за этот город части НКВД окружили поляков, обезоружили и интернировали. Некоторым из них удалось вырваться из окружения. И все же АК продолжала повстанческую акцию и ее отряды принимали участие в освобождении очередных городов: в случае больших городов (таких как Львов или Вильнюс) вместе с Красной Армией, а часто в самостоятельно проводимых атаках на небольшие немецкие гарнизоны. Например, в люблинской области войска АК самостоятельно освободили 7 городов и 11 вместе с советскими солдатами. «Буря» охватила широкую территорию от Карпат до Вильнюса и нижнего течения Буга, в боях принимали участие около 120 тыс. солдат. 30 июля Сталин дал приказ об обезоружении отрядов АК, а те представители местных властей Подпольного Государства, которые легализовались и начали выполнять служебные обязанности были арестованы. По крайней мере 20 - 30 тыс. человек были сосланы вглубь Советского Союза - большая часть из них никогда не вернулась на родину.